滇龙胆草多年生草本，高30-50厘米，须根肉质，主茎粗壮，有分枝。花枝多数，丛生，直立，坚硬，紫色或黄绿色，中空，近圆形。花多数，簇生枝端呈头状，稀腋生或簇生小枝顶端；无花梗；花萼倒锥形，裂片绿色；花冠蓝紫色或蓝色，冠檐具多数深蓝色斑点，漏斗形或钟形。蒴果内藏，椭圆形或椭圆状披针形；种子黄褐色，有光泽，矩圆形，表面有蜂窝状网隙。花果期8-12月。
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